CleanFinder: browserbasiertes Tool zur Analyse von Genom-Editierungen
Forschende veröffentlichen eine offene, datenschutzfreundliche Plattform, die CRISPR-, Base- und Prime-Editing-Ergebnisse auswertet — ohne Installation und ohne das Hochladen sensibler Daten. Die Arbeit wurde von Forschenden des Leibniz-Instituts für umweltmedizinische Forschung in Düsseldorf (IUF) gemeinsam mit Kollegen des Universitätsklinikums Düsseldorf, der ETH Zürich und der Universität Paris Cité durchgeführt. Auch wenn Technologien wie CRISPR die DNA mit einer Präzision umzuschreiben, wie es vor einer Generation noch undenkbar war, blie es bislang überraschend langsam und schwierig, die DNA anschließend auszulesen, um zu bestätigen, dass die beabsichtigte Veränderung - und nur diese - tatsächlich erfolgt ist. Dafür wurde der CleanFinder entwickelt, eine frei verfügbare, browserbasierte Plattform, die diese Editierungsergebnisse schnell und präzise auflöst — und zwar ohne sensible genomische Daten an externe Server zu senden. Die Arbeit ist in der Fachzeitschrift Trends in Biotechnology erschienen.